Modifikace, zvlášť u Mafie II jsou občas obtížné na instalaci. Ne ovšem vždy hledejte chybu u sebe, jelikož tam vždy není. 2K Games nemá modifikace v lásce a jako další důkaz nám předložili poslední update hry, který mění koncovky souborů s kamerovým systémem z xml na binární soubory. Díky této změně nyní nelze používat např. FPS mód.