Druhá Mafia měla mít původně více konců, z toho nápadu nakonec sešlo a tvůrci Mafia III nejspíše usoudili, že více konců se pro Mafii hodí. Hráč má po ruce tři kapitány – Vita, Burkeho a Cassandru a je jenom na Vás, pro koho budete plnit mise a komu přidělovat obsazené podniky a čtvrti. U jednotlivých kapitánů si budete totiž budovat reputaci a komu dáte více, ten Vám dá na oplátku také více možností. Ať už to jsou různé vylepšováky jako odvolání policie nebo mobilní zbrojnice, tak také různorodé mise a je možné, že Váš kamarád dostane od Vita misi, kterou Vy během hry nedostanete.

Jak se hráč budete proplétat pavučinou a plnit mise, bude si postupně odemykat daný konec. I když jejich oficiální počet neznáme, budou minimálně tři, jelikož máme tři kapitány.